วิชา การออกแบบงานวิจัยด้านการแพทย์แผนไทยและการแพทย์ทางเลือก เป็นการส่งเสริม รักษา ป้องกัน และฟื้นฟูโรคด้วยการแพทย์แผนไทยและการแพทย์ทางเลือก ถูกใช้และสืบทอดติดต่อกันมาเป็นเวลานาน โดยส่วนมากการถ่ายทอดมักเป็นในครอบครัว เครือญาติ ศิษย์อาจารย์ หรือจากตำรามาตรฐาน อย่างไรก็ดี เนื้อหาและความถูกต้องยังไม่ได้รับการพิสูจน์ด้วยหลักฐานเชิงประจักษ์มากเพียงพอ ทำให้การยอมรับด้านการแพทย์แผนไทยและการแพทย์ทางเลือกยังถูกจำกัดอยู่ในวงแคบ และไม่ได้รับการยอมรับเท่าที่ควรจากแพทย์แผนปัจจุบัน การออกแบบงานวิจัยด้านการแพทย์แผนไทยและการแพทย์ทางเลือกด้วยมาตรฐานเดียวกับงานวิจัยของแพทย์แผนปัจจุบัน จะช่วยให้การแพทย์แผนไทยและการแพทย์ทางเลือกมีหลักฐานที่สนับสนุน ประสิทธิภาพและประสิทธิผลในการรักษาโรคต่าง ๆ และสามารถคลายข้อกังขาที่มีในอดีตได้